9月2日下午，2020中国足协杯进行首轮比赛的抽签。经过抽签，大连赛区广州恒大淘宝对阵河南建业，上海绿地申花对阵广州富力。苏州赛区北京中赫国安遭遇青岛黄海青港，上海上港的对手是重庆当代。
由于疫情影响，2020赛季中国足坛各项赛事的赛制均与以往不同。足协杯首轮由中超16队参赛，8个胜者进入第2轮。第2轮由中超8队、中甲前8队参赛，8队进入第3轮。第3至5轮是8进4、4进2（两回合）、冠亚军决赛。
足协杯首轮抽签原则是：2019足协杯冠军、2019中超前7名共8支种子队与非8支种子队抽签对阵。第2轮比赛抽签原则是：中超8支球队设为种子队并分上、下半区，8支中超球队抽签对阵8支中甲球队，后续比赛按落位对阵。
首轮比赛将于9月18日在大连、9月19日在苏州赛区进行。第2-5轮比赛将于11月26日至12月19日进行，中超在苏州赛区，中甲在常州、江阴赛区。首轮具体对阵为：